林业论文_长白落叶松种子园遗传多样性分析
文章目录
0 引言
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 试验方法
1.2.1 基因组DNA提取
1.2.2 引物筛选
1.2.3 SSR-PCR反应体系和扩增程序
1.2.4 PCR产物电泳检测
1.2.5 数据统计与分析
2 结果与分析
2.1 引物质量分析
2.1.1 引物通用性分析
2.1.2 引物多态性分析
2.2 不同统计方法遗传多样性分析
2.3 聚类分析
2.4 群体遗传结构分析
3 讨论与结论
文章摘要:为分析长白落叶松生产群体的遗传多样性及其变化趋势,为落叶松优良种质资源收集、保护和多世代遗传改良提供科学依据。该文从270对松科SSR(Simple Sequence Repeat)通用引物中筛选出多态性高的30对引物,利用SSR分子标记对林口县青山林场长白落叶松种子园105个单株进行遗传分析。结果表明,30对引物共检测到258对等位基因,群体平均观测等位基因数(Average number of observed alleles,Na)为2.833,平均有效等位基因数(Average number of effective alleles,Ne)为1.814,平均观测杂合度(Average observed heterozygosity,Ho)为0.404,平均期望杂合度(Average expected heterozygosity,He)为0.401;群体内近交系数(Inbreeding coefficient in population,Fis)、群体总近交系数(Total inbreeding coefficient in population,Fit)均为负值,表现出群体轻微杂合子过量,未出现近交衰退现象;Shannon多样性指数(I)为0.694,多态性信息含量(Polymorphism Information Content, PIC)为0.354 1,具有较高遗传多样性,遗传变异主要源于群体内;UPGMA聚类图以0.692为阈值,可以将105个单株分为4个类群。该研究筛选出的SSR引物具有较好通用性,长白落叶松种子园遗传多样性较高,无性系群体遗传变异水平没有降低。
文章关键词:
论文作者:邱新宇 张磊 张含国 闫平玉
作者单位:东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室
论文DOI:10.16270/j.cnki.slgc.2022.03.015
论文分类号:S791.22